Los vigentes estatutos establecen en su artículo 22.1 que la Junta de Gobierno de la AMedEx estará compuesta por diez miembros:
a) Presidente.
b) Vicepresidente.
c) Secretario General.
d) Vicesecretario/Bibliotecario.
e) Tesorero
f) Dos vocales electos
g) Los Presidentes de los Ilustres Colegios Oficiales de Médicos de Badajoz (ICOMBA) y Cáceres (COMECA) (o personas en quienes estos deleguen), que actuarán en calidad de vocales.
h) Decano de la Facultad de Medicina de la Universidad de Extremadura (o persona en quien delegue), que actuará, como en el caso anterior, en calidad de vocal.
Miembros de la Junta de Gobierno

Presidente
Dr. Agustín Muñoz Sanz

Vicepresidenta
Dra. María Victoria González-López Arza

Secretario
Dr. Francisco de Asís Buitrago Ramírez

Bibliotecario
Dr. Gerardo
Blanco Fernández

Tesorera
Dra. María del Carmen Pazos Pacheco

Vocal
Dr. José María
Ramírez Moreno

Vocal
Dr. Pedro
Hidalgo Fernández

Vocal
Dr. Carlos
Arjona Mateos

Vocal
Dr. Francisco J.
Vaz Leal